Fast 2.000 unbekannte Bakterien entdeckt, die im menschlichen Darm: Forscher identifizieren Roman Darmbakterien-Arten und rufen Sie für weitere Daten aus über Europa und Nordamerika

Fast 2.000 unbekannte Bakterien entdeckt, die im menschlichen Darm: Forscher identifizieren Roman Darmbakterien-Arten und rufen Sie für weitere Daten aus über Europa und Nordamerika

2019-02-12

Forscher am EMBL – European Bioinformatics Institute und dem Wellcome Sanger Institute identifiziert haben fast 2000 Bakterienarten Leben im menschlichen Darm. Diese Arten sind noch nicht im Labor kultiviert. Das team verwendet eine Reihe von computergestützten Methoden zur analyse der Proben von Personen weltweit.

Die Ergebnisse, veröffentlicht in der Zeitschrift Natur, hervorzuheben, dass, obwohl Forscher sind möglicherweise näher zu kommen, erstellen Sie eine umfassende Liste der häufigsten Mikroben in der europäischen und nordamerikanischen gut, es gibt einen erheblichen Mangel an Daten aus anderen Regionen der Welt.

Der menschliche Darm ist Heimat für viele Arten von Mikroben, die zusammenfassend als die Darm-mikrobiota. Trotz umfangreicher Studien auf dem Gebiet, die Forscher arbeiten noch an der Identifizierung der einzelnen Mikroben-Arten, die Leben in unseren Eingeweiden und verstehen, welche Rolle Sie spielen in der menschlichen Gesundheit.

‚Rekonstruktion‘ Bakterien

Es gibt viele Gründe, warum einige mikrobielle Spezies, die Teil der Darm-mikrobiota haben, unbekannt geblieben ist, so lange, wie eine geringe fülle, die im Darm oder eine Unfähigkeit zu überleben außerhalb. Durch die Verwendung von computergestützten Methoden konnten die Forscher rekonstruieren, wie die Genome dieser Bakterien.

„Computergestützte Methoden ermöglichen es uns, zu verstehen, Bakterien, dass wir noch nicht die Kultur im Labor. Mit metagenomics zu rekonstruieren bakterielle Genome ist ein bisschen wie zu rekonstruieren, Hunderte von Rätseln nach dem mischen alle Teile zusammen, ohne zu wissen, wie das endgültige Bild Aussehen soll, und nach dem vollständigen entfernen ein paar Stücke aus der mix einfach zu machen, dass es etwas schwieriger werden“, sagt Rob Finn, Gruppenleiter am EMBL-EBI. „Die Forscher sind jetzt in einem Stadium, wo Sie verwenden können, eine Reihe von computergestützten tools zur Ergänzung und manchmal guide arbeiten im Labor, um zu entdecken, neue Einblicke in den menschlichen Darm.“

Geografische Vielfalt

Die Forschung hervorgehoben, wie die Zusammensetzung der Darmbakterien, unterscheidet sich auf der ganzen Welt, und wie wichtig es ist, für die Proben, die wir untersuchen, um diese Vielfalt reflektiert.

„Wir sehen eine Menge von der gleichen Bakterien-Spezies auftauchen, in der Daten aus der europäischen und nordamerikanischen Bevölkerung“, so Finn. „Allerdings sind die wenigen südamerikanischen und afrikanischen datasets hatten wir Zugang zu für diese Studie ergab signifikante Vielfalt nicht in der ehemaligen Bevölkerung. Dies deutet darauf hin, dass das sammeln von Daten aus unterrepräsentierten Bevölkerungsgruppen ist unerlässlich, wenn wir erreichen wollen, um ein wirklich umfassendes Bild von der Zusammensetzung des menschlichen Darms.“

Blaupause des menschlichen Darms

„Numerische Methoden, die uns erlauben, zu erhalten eine Idee von der viele Bakterienarten Leben im menschlichen Darm, wie Sie entstanden sind und welche Art von Rolle, die Sie spielen können in Ihrer mikrobiellen Gemeinschaft“, sagt Alexandre Almeida, Postdoctoral Fellow bei EMBL-EBI und dem Wellcome Sanger Institute. „In dieser Studie setzten wir die umfangreichsten öffentlich zugänglichen Datenbanken des Magen-Darm-Bakterien zu identifizieren, Bakterien-Spezies wurden nicht gesehen, vor. Die Analyse-Methoden, die wir verwendet, sind in hohem Maße reproduzierbar und kann angewendet werden, um größere, diverse Datensätze in der Zukunft, die eine weitere Entdeckung.“

„Forschungen wie diese hilft uns, erstellen eine so genannte Blaupause des menschlichen Darms, die in der Zukunft könnte uns helfen zu verstehen, die menschliche Gesundheit und Krankheit besser und konnte sogar guide Diagnose und Behandlung von Magen-Darm-Erkrankungen“, fasst Trevor Lawley, Gruppenleiter am Wellcome Sanger Institute.