Wissenschaftler enthüllen umfassende Proteom-Karte von menschlichen Lungen-Adenokarzinom

Wissenschaftler enthüllen umfassende Proteom-Karte von menschlichen Lungen-Adenokarzinom

2020-07-09

Ein team von chinesischen Wissenschaftlern der State Key Laboratory of Drug Research, Shanghai Institute of Materia Medica unter der chinesischen Akademie der Wissenschaften, zusammen mit multi-institutionellen Mitarbeiter, hat kürzlich eine umfassende Proteom-Analyse basierend auf 103 chinesischen Patienten mit Lungen-Adenokarzinom (LUAD), eine führende Todesursache unter allen Krebsarten weltweit.

Die Untersuchung ergab LUAD-bezogenen molekularen Eigenschaften, Ihrer Assoziation mit klinischen Ergebnissen, mögliche prognostische Biomarker und drug targets. Diese Studie wurde online veröffentlicht in Zell – am 9. Juli.

Trotz bemerkenswerter Fortschritte in der Genom-Studie von LUAD in den letzten Jahren ein großer Prozentsatz der LUAD Patienten immer noch fehlt, ist die gezielte therapeutische Strategien. Da Proteine sind die direkten Vollstrecker von biologischen Aktivitäten, eine umfassende Proteom-Studie von LUAD, füllt die Wissenslücke zwischen genomische Abnormalität und onkogenen protein-Funktion.

Um ein umfassendes Verständnis der molekularen Landschaft LUAD und bieten die Möglichkeit für eine präzisere Diagnose und Behandlung von LUAD, Wissenschaftler in diese Studie integriert, Proteom-und phosphoproteomic Analysen der tumor-Geweben und deren gepaart noncancerous den angrenzenden Geweben von 103 LUAD Patienten. Insgesamt 11,119 Proteine und 22,564 Phosphorylierung Websites identifiziert wurden. Die Kombination dieser Proteomik-Daten mit den klinischen Informationen und Genomik Daten, eine umfassende molekulare Landschaft LUAD erhalten wurde.

Die Wissenschaftler entdeckten, dass die epitheliale-mesenchymale transition, sowie entzündliche und Onkogene Signalwege, wahrscheinlich führte zu der schlechten Prognose im Stadium I LUAD. Sie etablierte verbindungen zwischen genetischen Veränderungen und Proteom-Merkmale bei Patienten mit mutation von EGFR oder TP53 -, zwei vorherrschende Treiber-Gene in der chinesischen LUAD Patienten.

Erhöhte expression von zwei histologische Marker, TTF-1 und Napsin-A, und-Proteine in spliceosomes beobachtet wurden, bei Patienten mit EGFR-mutation. Bei den Patienten mit TP53-mutation, mehrere Onkogene Signalwege, einschließlich DNA-Replikation und-mismatch-Reparatur, verändert wurden spürbar.

Die Forscher klassifiziert alle Patienten, die in drei Proteom-Subtypen (S-I, S-II, S-III), die jeweils unterschiedliche molekulare Eigenschaften und klinische Merkmale. Umfassende bioinformatische Analyse zeigte, dass die S-I-Patienten wurden im Zusammenhang mit einer zellulären Umgebung und eine gute Prognose. Im Gegensatz, S-III-Patienten wurden im Zusammenhang mit der Zellproliferation und der Proteom-Stabilität und eine schlechte Prognose. Die phosphoproteomic Analyse weiter ergab aktiviert Signalwege und Kinasen in verschiedenen Proteom-Subtypen. Die integrative Analyse von Proteomik-Daten und klinischen Daten weiter ergab 27 potentiellen plasma-Biomarkern und mehrere Angriffspunkte für LUAD. HSP 90β, eine der potentiellen Biomarker, wurde weiter validiert in einer unabhängigen Kohorte.